TRIM69: marcador de metástasis y potencial sensibilizador a 5

BMC Gastroenterology volumen 23, número de artículo: 292 (2023) Citar este artículo

Detalles de métricas

Varias proteínas de la familia de motivos tripartitos (TRIM) están asociadas con el desarrollo del cáncer colorrectal (CCR), pero faltaba investigación sobre el papel de TRIM69. El presente estudio examinó la correlación entre la expresión de TRIM69 y el adenocarcinoma de colon (COAD).

Los datos de secuenciación de ARNm para pacientes con COAD se extrajeron de The Cancer Genome Atlas para analizar las correlaciones entre la expresión de TRIM69 y las características clínicas de los pacientes, así como la supervivencia. También se predijeron posibles asociaciones con células inmunitarias y quimiosensibilidad utilizando varios algoritmos en las plataformas TIMER, Limma, clusterProfiler, GeneMANIA y Gene Set Cancer Analysis. Posteriormente, se utilizaron análisis de reacción en cadena de la polimerasa y tinción inmunohistoquímica para detectar la expresión de TRIM69 en muestras de tejido COAD de pacientes del mundo real.

La expresión de TRIM69 fue menor en los tejidos COAD que en los tejidos normales y se correlacionó con el estadio patológico y la metástasis (categoría M). Además, se descubrió que TRIM69 estaba involucrado en varias vías relacionadas con el sistema inmunológico, en particular la vía de señalización similar a NOD. Estos resultados sugieren que la alta expresión de TRIM69 tiene el potencial de mejorar la sensibilidad del tumor al 5-fluorouracilo y a los bloqueadores de la proteína de muerte celular programada 1 (PD-1).

A partir de nuestros hallazgos de que la expresión de TRIM69 se redujo significativamente en COAD en comparación con los tejidos no cancerosos y se asoció con el estadio patológico y la metástasis, llegamos a la conclusión de que aumentar la expresión y/o actividad de TRIM69 puede ayudar a mejorar los resultados terapéuticos. En consecuencia, TRIM69 representa un marcador potencialmente valioso de metástasis y un objetivo para la terapia adyuvante en COAD.

Informes de revisión por pares

El cáncer colorrectal (CCR) es la neoplasia maligna más común que ocurre en el tracto gastrointestinal y causa aproximadamente 600.000 muertes por cáncer anualmente en todo el mundo [1]. El CCR se clasifica según varios tipos, y el adenocarcinoma de colon (COAD) es el tipo más prevalente. Los factores de riesgo conocidos del CCR incluyen el envejecimiento, el consumo de alcohol, la obesidad, el tabaquismo y el alto consumo de carne [2]. En las últimas décadas, los principales avances en la terapia de precisión para el CCR han aumentado considerablemente el tiempo de supervivencia de los pacientes [3]. Actualmente, el tratamiento primario consiste en cirugía combinada con quimioterapia adyuvante y/o terapia farmacológica dirigida. Debido a que la mayoría de los casos de CCR se diagnostican en una etapa avanzada y frecuentemente con metástasis a distancia, la supervivencia a largo plazo sigue siendo insatisfactoria para la mayoría de los pacientes [4]. Para desarrollar planes de tratamiento individualizados y programas de revisión para pacientes con CCR, los médicos necesitan información precisa sobre el estado de los pacientes. Por lo tanto, todavía se necesita investigación para identificar nuevos marcadores biológicos moleculares y dianas terapéuticas para el CCR.

La familia de proteínas con motivos tripartitos (TRIM), también denominada familia de proteínas RING, B-Box y Coiled-coil (RBCC), está formada por proteínas que contienen motivos tripartitos. La mayoría de las proteínas TRIM funcionan como ubiquitina ligasas E3 para degradar las proteínas diana [5]. En estudios recientes, se ha descubierto que las proteínas de la familia TRIM desempeñan funciones cruciales en una amplia variedad de afecciones patológicas, incluidas la inflamación, las enfermedades infecciosas y el cáncer, y su interacción con p53 también contribuye a estas afecciones [6]. En el CCR, también se ha informado que varias proteínas de la familia TRIM están relacionadas con la proliferación, la apoptosis y la metástasis de células tumorales [7,8,9]. El nuevo gen TRIM69 se clonó a partir de una biblioteca de ADNc derivada de testículos humanos. Al igual que otros miembros de la familia de proteínas TRIM, TRIM69 contiene el dominio estructural RBCC clásico [10]. Aunque TRIM69 se ha identificado en varios procesos y vías relacionados con la tumorigénesis, hasta donde sabemos, la participación de TRIM69 en el desarrollo de tumores aún no se comprende completamente y no se ha estudiado en el CCR.

Para el presente estudio, descargamos datos transcriptómicos de The Cancer Genome Atlas (TCGA) para COAD para el análisis de la expresión de TRIM69 junto con las características clínicas de los pacientes. Posteriormente, los tejidos tumorales y paraneoplásicos de pacientes con COAD recolectados durante la consulta clínica se sometieron a análisis de PCR de transcripción inversa cuantitativa (RT-qPCR) en tiempo real e inmunohistoquímica para detectar la expresión de TRIM69 en diferentes niveles. Nuestros análisis determinaron que la expresión de TRIM69 fue significativamente menor en el tejido COAD que en los tejidos normales y se correlacionó con el estadio patológico y la metástasis (categoría M). Por lo tanto, TRIM69 puede servir como marcador de COAD y proporcionar un mecanismo adyuvante para mejorar la eficacia de diversos agentes quimioterapéuticos contra el cáncer, como el 5-fluorouracilo y los inhibidores de la proteína de muerte celular programada 1 (PD-1).

Los datos de expresión de ARNm descargados de TCGA-COAD incluyeron 524 perfiles de expresión de ARNm en total, incluidos 482 para tejidos COAD y 42 para tejidos de colon normales. Para identificar correlaciones entre la expresión de TRIM69 y las características clínicas de COAD, se utilizó Limma (versión 3.52.4) para calcular los coeficientes de correlación para la expresión de TRIM69 y la edad, el estadio patológico y los estadios patológicos TNM. También calculamos el coeficiente de correlación de Pearson para la expresión TRIM69 y TMB. Además, se extrajo la matriz de expresión TRIM69 para análisis de expresión diferencial y análisis de supervivencia.

En TIMER 2.0, se analizaron 10.897 muestras que representan 32 tipos de cáncer para determinar si diferentes tipos de células inmunitarias se han infiltrado en los tumores. Se utilizaron los algoritmos TIMER, quanTIseq, CIBERSORT, xCell, TIDE, EPIC y MCP-counter para calcular el contenido de células inmunes previsto [11]. Se aplicó el análisis de Spearman para estimar la pureza de las células tumorales y el módulo "gen" se utilizó además para investigar la relación entre la expresión de TRIM69 y la infiltración de células inmunes, incluidas las células T CD8+, las células T CD4+, las células B y las células dendríticas. , macrófagos y neutrófilos.

Según la expresión media de TRIM69 en los pacientes, los pacientes con COAD se dividieron en grupos de alta y baja expresión. El paquete Limma se utilizó para identificar los genes expresados diferencialmente en los grupos TRIM69 de alta y baja expresión [12]. El paquete clusterProfiler versión 3.16.0 se utilizó para GSEA [13].

GeneMANIA es una plataforma en línea para analizar listas de genes, generar hipótesis sobre la función de los genes y priorizar genes para estudios funcionales [14]. En este estudio, se identificaron proteínas que interactúan con TRIM69 utilizando GeneMANIA.

TRIM69 y los genes que interactúan con TRIM69 se ingresaron en g: Profiler [15]. El análisis de enriquecimiento funcional se realizó mediante g: GOSt. Se seleccionaron las siguientes fuentes de datos: GO Molecular Function, GO Cellular Component, GO Bioprocess, KEGG [16,17,18], Reactome y WikiPathways. Se realizaron análisis de enriquecimiento GO y KEGG (herramientas DAVID, https://david.ncifcrf.gov/) para los genes principales.

Para identificar genes que están altamente correlacionados con TRIM69 y que pueden estar relacionados funcionalmente en tejidos tumorales, se calcularon coeficientes de correlación parcial. Se utilizaron como condiciones de filtro un coeficiente de correlación parcial > 0,6 y p < 0,001. Los resultados se visualizaron con el paquete ggplot2 versión 3.3.6.

Dentro del Gene Set Cancer Analysis (GSCA), una plataforma integrada para el análisis de conjuntos de genes genómicos, farmacogenómicos e inmunogenómicos en el cáncer [19], se utilizó el módulo Drug para calcular la sensibilidad al fármaco entre las células tumorales según el nivel de expresión de TRIM69. basado en datos de los proyectos Genómica de la sensibilidad a los fármacos en el cáncer (GDSC) y The Cancer Therapeutics Response Portal (CTRP).

El bloqueo de puntos de control inmunológico es una estrategia importante en la inmunoterapia antitumoral. La Cancer Immunome Database (TCIA) proporciona análisis inmunogenómicos sistemáticos de 20 tumores sólidos utilizando datos de TCGA. En este estudio, se descargaron de TCIA las IPS para los bloqueadores CTLA-4 y PD-1 de 457 pacientes con COAD para predecir la sensibilidad a la inmunoterapia.

La expresión del ARNm de TRIM69 se detectó mediante análisis RT-qPCR en tejidos cancerosos y paraneoplásicos de 141 pacientes con COAD del mundo real. Todas las muestras de tejido se obtuvieron de pacientes tratados en el Departamento de Oncología Médica del Primer Hospital Afiliado de la Universidad Médica de Guangxi entre febrero de 2022 y junio de 2022. Este proyecto fue aprobado por el Comité de Aprobación Ética del Primer Hospital Afiliado de la Universidad Médica de Guangxi (No .2022-KT-transverse item-029), y la privacidad de los pacientes estuvo bien protegida durante todo este proyecto.

Extrajimos el ARN total de los tejidos utilizando el reactivo RNAiso Plus (Takara, Dalian, China) y el ARNm se transcribió de forma inversa en ADNc utilizando el kit PrimeScript TM RT (Takara). Luego, se realizó RT-qPCR utilizando SYBR® Premix Ex TaqTM II (Takara). Las secuencias de los cebadores en este análisis se presentan en la Tabla 1 y se utilizó β-actina como referencia endógena para la normalización. La expresión relativa se calculó utilizando el método 2 – ΔΔCt [20]. Además, cada experimento se realizó tres veces.

La expresión de TRIM69 se detectó mediante inmunohistoquímica en tejidos normales cancerosos y paracancerosos de 4 pacientes con COAD. Todas las muestras de tejido se obtuvieron de pacientes tratados en el Departamento de Oncología Médica del Primer Hospital Afiliado de la Universidad Médica de Guangxi entre febrero de 2022 y junio de 2022. Después de desparafinar los portaobjetos durante 20 minutos a 80 °C, se sumergieron tres veces en una solución de xileno. baño durante 5 min cada vez. Los portaobjetos se lavaron secuencialmente dos veces con etanol al 100% durante 30 s, etanol al 95% durante 30 s y etanol al 75% durante 30 s. Luego se colocaron en una olla a presión a alta presión durante 5 min. Después de enjuagar con solución salina tamponada con fosfato (PBS), los portaobjetos se incubaron durante la noche a 4 °C con el anticuerpo primario (ABclonal) diluido en PBS. Después de la incubación durante la noche a 4 °C, los portaobjetos se enjuagaron en PBS y se incubaron con anticuerpos secundarios durante 30 minutos a 37 ℃.

Para realizar un análisis semicuantitativo de inmunohistoquímica, se utilizaron los siguientes criterios. Según la intensidad de la tinción, las células se calificaron de la siguiente manera: 0 teñidas negativamente, 1 teñida débilmente (amarillo pálido), 2 teñidas moderadamente (amarillo pardusco) y 3 teñidas fuertemente (sepia). Según el porcentaje de células positivas, las puntuaciones de la proporción positiva son las siguientes: 1, 25 % o menos; 2, 26-50%; 3, 51-75%; 4, 76% o más. Finalmente, calculamos la puntuación inmunohistoquímica multiplicando las puntuaciones de intensidad de tinción y las puntuaciones de proporción positiva.

Se realizó una prueba bilateral de significación estadística utilizando la media y la desviación estándar de las mediciones, así como p <0,05 para la significación estadística. Comparamos las diferencias entre dos grupos y múltiples grupos utilizando la prueba t de Student y el análisis de varianza unidireccional (ANOVA), respectivamente. Para las comparaciones de datos categóricos se utilizó la prueba de Chi-cuadrado o el método de probabilidad exacta de Fisher. Se utilizaron R 4.2.1 y GraphPad (versión 8.0) para realizar gráficos estadísticos.

Según los datos de TCGA, la comparación de la expresión de TRIM69 en tejidos COAD y tejidos no cancerosos reveló que el nivel de expresión de TRIM69 en COAD fue significativamente menor que el de los tejidos no cancerosos (p <0,05; Fig. 1A). También se observaron diferencias significativas en la expresión de TRIM69 entre los estadios patológicos y las categorías M (p <0,05; Fig. 1C, F y G). La expresión del ARNm de TRIM69 disminuyó con el aumento del estadio patológico, observándose el nivel más bajo de expresión del ARNm de TRIM69 en los casos en estadio patológico IV. De hecho, la expresión del ARNm de TRIM69 fue significativamente menor en el estadio IV COAD que en los otros estadios patológicos. Además, como lo demuestran los resultados en la Fig. 1H, la expresión de TRIM69 en COAD se correlacionó positivamente con la carga de mutaciones tumorales (TMB).

Expresión de TRIM69 en pacientes con COAD dentro de TCGA. (A) La expresión de TRIM69 es menor en el tejido COAD que en el tejido normal. (BF) Diagramas de caja y (G) mapa de calor para las asociaciones entre la expresión de TRIM69 y las características clínicas de los casos de COAD. (H) Correlación de la expresión de TMB y TRIM69. (I) Supervivencia general entre pacientes con expresión alta o baja de TRIM69 en tejidos COAD. (J) Supervivencia libre de enfermedad entre pacientes con expresión alta o baja de TRIM69 en tejidos COAD. (*p < 0,05; **p < 0,01; y ***p < 0,001)

La expresión de TRIM69 no varió significativamente según las diferencias en la edad, el estadio T patológico o el estadio N patológico (Fig. 1B, D y E). Además, no hubo una asociación estadísticamente significativa entre la expresión de TRIM69 y la supervivencia general (SG) o la supervivencia libre de enfermedad (SSE; Fig. 1I-J).

Estudios anteriores han demostrado que varios miembros de la familia de proteínas TRIM, incluido TRIM69, están involucrados en las respuestas inmunes a los virus [21, 22]. Para investigar la relación entre la expresión de TRIM69 y la infiltración de células inmunitarias en COAD, se utilizaron datos de la base de datos TIMER. Como se muestra en la Fig. 2, las 10 correlaciones positivas más significativas se observaron entre la expresión de TRIM69 y la infiltración de tejido COAD por varias células inmunitarias, incluidas las células dendríticas mieloides activadas, los neutrófilos y los monocitos (consulte la Tabla complementaria S1 para obtener resultados detallados de las células inmunitarias). predicción de infiltración).

La expresión de TRIM69 se correlaciona positivamente con la infiltración de múltiples tipos de células inmunes en COAD

Mediante el análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes (GSEA), se identificaron algunas entradas de Gene Ontology (GO) y Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) como asociadas significativamente con la expresión de TRIM69 en COAD, incluidas funciones y vías relacionadas con el sistema inmunológico, como la mediada por células B. inmunidad, respuestas inmunes humorales circulantes mediadas por inmunoglobulinas, complejos de receptores de células T, moléculas de adhesión celular y vías de señalización de quimiocinas (Fig. 3A-B). GeneMANIA identificó 20 proteínas que interactúan con TRIM69 (Fig. 3C). G: El análisis del perfilador mostró que estas proteínas están asociadas principalmente con la adhesión entre células, la coestimulación de células T y la coestimulación de linfocitos (Fig. 3D). Estos resultados son consistentes con nuestro análisis de infiltración inmune que muestra una asociación entre la expresión de TRIM69 y la infiltración de múltiples tipos de células inmunes.

Análisis de enriquecimiento y redes de interacción de proteínas. (AB) Evaluación GSEA de los términos GO y KEGG asociados con la expresión TRIM69 en COAD. (CD) Red de interacción de proteínas para TRIM69 y análisis de enriquecimiento de sobreexpresión

Se llevó a cabo un análisis de coexpresión genética para construir una red de coexpresión. En total, se identificaron 41 genes que cumplían con los criterios (Tabla 2). Los resultados de los análisis de enriquecimiento de GO y KEGG se presentan en las figuras 4A-B. Los términos GO reflejaban genes que contribuyen principalmente a la unión a proteínas, al citosol y a la respuesta inmune. El análisis de enriquecimiento de la vía KEGG indicó que estos genes están enriquecidos en la vía de señalización del receptor tipo NOD, el procesamiento y presentación de antígenos, la vía de señalización de quimiocinas y las moléculas de adhesión celular. En conjunto, estos hallazgos indican que el microambiente tumoral podría estar regulado por estos genes en COAD.

Análisis de coexpresión para TRIM69. (A) Análisis de enriquecimiento del término GO. (B) Análisis de enriquecimiento de términos KEGG. (C) Gráficos circulares para el análisis de coexpresión de TRIM69 (correlación positiva, rojo; correlación negativa, verde)

El gráfico de coexpresión en la Fig. 4C muestra la relación entre la expresión TRIM69 y los 5 primeros negativamente (verde; GBP1, PARP9, STAT1, GBP4 e IFIT3) y los 6 primeros positivamente (rojo; B2M, SPIRE2, SYT7, TNNC2, IHH , y ENGASE) genes correlacionados. Estos genes se enriquecieron en la vía de señalización del receptor tipo NOD. Los resultados anteriores llevaron a la hipótesis de que TRIM69 podría influir en el microambiente inmunológico del tumor mediante la regulación de la señalización del receptor tipo NOD.

Se aplicó el análisis de cáncer de conjunto de genes (GSCA) para analizar la sensibilidad de las células tumorales a diferentes fármacos contra el cáncer según el nivel de expresión de TRIM69. La expresión de TRIM69 se correlacionó significativamente positivamente con los valores de la mitad de la concentración inhibidora máxima (IC50) para 17-AAG, RDEA119 y trametinib, así como también se correlacionó significativamente negativamente con los valores de IC50 para 5-fluorouracilo, AT-7519, CAL-101 y indisulam (Fig. 5A-B). Estos resultados sugieren que una mayor expresión de TRIM69 podría aumentar la sensibilidad de las células de cáncer de colon al 5-fluorouracilo, AT-7519 y CAL-101.

Relaciones entre la expresión de TRIM69 y la eficacia de la quimioterapia oncológica (CI50). (A) Correlación entre la sensibilidad a la expresión de ARNm de GDSC y TRIM69. (B) Correlación entre la sensibilidad a la expresión de ARNm de CTRP y TRIM69. (CF) Valores de IPS para bloqueadores CTLA-4 y PD-1 en 457 pacientes con COAD

Comparamos las puntuaciones de inmunoterapia (IPS) para los bloqueadores CTLA-4 y PD-1 entre grupos de pacientes con COAD con expresión alta y baja de TRIM69. Como se muestra en las figuras 5C-F, los pacientes con estado positivo de PD-1 en el grupo TRIM69 de alta expresión tuvieron buenas respuestas a un inhibidor de PD-1.

Según el análisis RT-qPCR de tejidos tumorales y tejidos normales paracancerosos de 141 pacientes con COAD, la expresión de TRIM69 fue significativamente menor en tejidos tumorales que en tejidos normales paracancerosos no malignos (Fig. 6A) y fue marcadamente diferente en los tejidos cancerosos de diferentes patologías. etapas y diferentes etapas M (Fig. 6B-C), de acuerdo con los resultados encontrados en el análisis de los datos de pacientes COAD de la base de datos TCGA (consulte la Figura complementaria S1 para obtener resultados detallados para la edad, diferentes etapas T y diferentes etapas N).

La expresión de TRIM69 se verificó en los niveles de ARNm y proteína en los 141 pacientes con COAD. (A) Niveles relativos de expresión de ARNm de TRIM69 en tejidos COAD y tejidos normales mediante RT-qPCR. Niveles relativos de expresión de ARNm de TRIM69 en diferentes estadios patológicos (B) y diferentes estadios M (C) de pacientes del mundo real con COAD. (D) Expresión de TRIM69 en tejidos COAD y tejidos normales observada mediante tinción inmunohistoquímica

Los resultados del análisis de tinción inmunohistoquímica y la puntuación inmunohistoquímica (Fig. 6D) respaldaron los hallazgos de RT-qPCR para la expresión diferente de TRIM69 entre tejidos tumorales y tejidos normales.

Se cree que varios factores contribuyen al desarrollo de COAD, incluida la activación oncogenética y la eliminación de genes supresores del cáncer [23]. En los últimos años, se ha sugerido que varias proteínas de la familia TRIM están reguladas al alza o a la baja y desempeñan funciones importantes en la COAD. Por ejemplo, se demostró que la regulación positiva de TRIM14 inducida por hipoxia inhibe la proliferación e invasión de células HCT116, SW480, HT29 y LoVo [7]. Además, se descubrió que la expresión de TRIM21 se reduce en los cánceres asociados con la colitis y regula negativamente la carcinogénesis epitelial intestinal mediante la modulación de la proliferación, adhesión, remodelación de tejidos y angiogénesis de las células epiteliales, así como las respuestas proinflamatorias [24]. Se ha informado que TRIM15, TRIM52 y TRIM67, entre otros, están asociados con la malignidad de COAD [8, 25, 26].

Hasta donde sabemos, no se había examinado el papel funcional específico de TRIM69 en el desarrollo de COAD. Un estudio de cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC) demostró que TRIM69 está asociado con los polos del huso y promueve la agrupación de centrosomas, que es esencial para la formación de husos bipolares, y que la detención mitótica causada por el silenciamiento de TRIM69 inhibe el crecimiento tumoral in vivo [27 ]. Estudios adicionales han demostrado que TRIM69 participa en numerosos procesos y vías subyacentes a la tumorigénesis. Rong et al. demostró que tras el silenciamiento de TRIM69, se promueve la apoptosis y la producción de ROS, y TRIM69 interactúa con p53 e induce su ubiquitinación [28]. Los resultados del presente estudio indican que TRIM69 se expresa diferencialmente en diferentes tipos de tejido y en tejidos tumorales según el estadio patológico o estadio M, aunque no se asocia estadísticamente con la SG o la SSE. Por lo tanto, especulamos que TRIM69 puede desempeñar un papel importante en el desarrollo de COAD.

La invasión y la metástasis no son sólo las características biológicas básicas de los tumores, sino que son factores clave que promueven la progresión de los tumores malignos [29]. Los pacientes con COAD se agruparon según rasgos clínicos para investigar la expresión de TRIM69 correlacionada con diferencias en estos rasgos. A partir de este análisis, se detectó una expresión más baja de TRIM69 en tejidos COAD que en tejidos no cancerosos mediante RT-qPCR e inmunohistoquímica. La expresión de TRIM69 también se correlacionó con el estadio patológico y la categoría M de COAD, lo que sugiere que TRIM69 puede servir como marcador de metástasis en COAD y potencialmente ser un nuevo supresor del cáncer de colon. Los resultados de nuestros experimentos sugirieron que el nivel de expresión de TRIM69 puede influir en la respuesta a diferentes terapias para COAD.

Dada la etiología molecular de la COAD, es probable que la selección adecuada del tratamiento farmacológico sea importante para estos pacientes. Aunque los fármacos de control inmunológico y las terapias con células T con receptores de antígenos quiméricos han mejorado considerablemente la supervivencia de algunos tipos de cáncer, el progreso relacionado con la aplicación clínica de inmunoterapias para la COAD ha sido lento [30]. El 5-fluorouracilo sigue siendo el agente quimioterapéutico estándar de primera línea utilizado para tratar la COAD. Sin embargo, en la mayoría de los casos, los tumores que inicialmente responden a la terapia con 5-fluorouracilo eventualmente desarrollan quimiorresistencia [31]. En este estudio, encontramos que la expresión de TRIM69 se correlacionaba negativamente con la CI50 de varios fármacos de quimioterapia, incluidos 5-fluorouracilo, AT-7519, CAL-101 e indisulam. Esto sugiere que el aumento de la expresión de TRIM69 podría mejorar los efectos terapéuticos de varios fármacos contra el cáncer. También encontramos que la expresión TRIM69 influyó en el IPS de los bloqueadores PD-1 en COAD. Por lo tanto, los pacientes positivos para PD-1 con expresión TRIM69 de alto nivel tienen más probabilidades de beneficiarse de los bloqueadores de PD-1. De esta manera, nuestros hallazgos proporcionan información sobre una estrategia terapéutica potencialmente novedosa para la COAD.

Como potente inhibidor de la infección por el virus de la estomatitis vesicular (VSV), TRIM69 regula la supresión inmune innata de una variedad de infecciones virales [32]. TRIM69 restringe la replicación del virus del dengue ubiquitinando específicamente las proteínas no estructurales del virus [33]. Inicialmente exploramos el posible papel de TRIM69 en la inmunidad tumoral utilizando la base de datos TIMER2.0 y GSEA y observamos una correlación positiva significativa entre la expresión de TRIM69 y la infiltración de varios tipos de células inmunes, incluidas las células dendríticas mieloides activadas, los neutrófilos y los monocitos. Los resultados de GSEA también revelaron que TRIM69 puede estar involucrado en numerosos procesos y vías relacionados con el sistema inmunológico en COAD. Aún así, estudios adicionales aún deben confirmar si TRIM69 puede inhibir el desarrollo de tumores a través de efectos relacionados con el sistema inmunológico.

Para estudiar las vías de señalización específicas que subyacen al papel de TRIM69 en COAD, primero realizamos un análisis de coexpresión para definir genes reguladores clave. Los resultados de los análisis de enriquecimiento de genes reguladores clave con GO y KEGG revelaron su participación en las respuestas inmunitarias y las vías de señalización relacionadas. Además, el análisis KEGG de los genes principales mostró su enriquecimiento en la vía de señalización del receptor tipo NOD (p <0,05). La vía de señalización del receptor tipo NOD desempeña un papel clave en el reconocimiento de patógenos y la respuesta inmune innata. Aunque falta evidencia exacta de la relación entre TRIM69 y la vía de señalización del receptor tipo NOD, podemos especular que TRIM69 puede estar involucrado en la respuesta antitumoral a través de la vía de señalización del receptor tipo NOD.

En conclusión, el presente estudio mostró que TRIM69 estaba significativamente disminuido en COAD en comparación con los tejidos no cancerosos, y el nivel de expresión de TRIM69 se asoció con el estadio patológico y la metástasis. De acuerdo con esto, el nivel de expresión de ARNm de TRIM69 fue bajo en el tejido tumoral. En particular, la expresión de TRIM69 mostró correlaciones negativas significativas con los valores de IC50 de varios fármacos contra el cáncer, incluidos 5-fluorouracilo, AT-7519, CAL-101 e indisulam. Por lo tanto, aumentar la expresión o actividad de TRIM69 puede ayudar a mejorar los resultados terapéuticos. Según los cálculos de IPS, los bloqueadores de PD-1 pueden ser una estrategia terapéutica eficaz para COAD con mayor expresión de TRIM69. Nuestros experimentos también proporcionan evidencia de que TRIM69 puede mejorar el microambiente inmunológico del tumor a través de la respuesta inmune, específicamente la vía de señalización del receptor tipo NOD. Sin embargo, se requieren más investigaciones para confirmar los mecanismos subyacentes de la función TRIM69 en COAD.

Los conjuntos de datos analizados durante el estudio actual están disponibles en el Portal de datos Genomic Data Commons, [https://portal.gdc.cancer.gov/repository].

Análisis de variación

Cáncer colonrectal

Adenocarcinoma de colon

Supervivencia libre de enfermedad

Análisis del cáncer de conjunto de genes

Ontología de genes

Análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes.

Genómica de la sensibilidad a los fármacos en el cáncer

El portal de respuesta a la terapia contra el cáncer

Análisis del cáncer de conjunto de genes

Puntuaciones de inmunoterapia

Enciclopedia de genes y genomas de Kioto

Cáncer de pulmón de células no pequeñas

ANILLO, B-Box y bobina enrollada

Sobrevivencia promedio

El atlas del genoma del cáncer

Carga de mutaciones tumorales

motivo tripartito

Virus de la estomatitis vesicular

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Este estudio fue financiado con fondos del Proyecto de Promoción de la Capacidad Básica para Profesores Universitarios Jóvenes y de Mediana Edad en Guangxi (2020KY03016); el Proyecto de Investigación del Departamento de Salud de Guangxi (z20190853); el Programa de Estudiantes para la Innovación y el Emprendimiento de la Universidad Médica de Guangxi (X202210598339); y el Programa de Investigación Clínica “Escalada” del Primer Hospital Afiliado de la Universidad Médica de Guangxi (YYZS2020023); Proyecto de investigación del Departamento de Salud de Guangxi (Z-A20230495).

Xiao-Jv Chi y Yi-Bei Song contribuyeron igualmente a este trabajo.

Departamento de Laboratorio Clínico, Primer Hospital Afiliado de la Universidad Médica de Guangxi, Laboratorio Clave de Medicina de Laboratorio Clínico del Departamento de Educación de Guangxi, Región Autónoma Zhuang de Guangxi, 6 Shuangyong Road, Nanning, 530021, China

Xiao-Jv Chi, Yi-Bei Song, Deng-He Liu, Li-Qiang Wei y An-Ran Zhao

Universidad Médica de Guangxi, Región Autónoma Zhuang de Guangxi, 22 Shuangyong Road, Nanning, 530021, China

Xin An, Zi-Zhen Feng, Xiao-Hua Lan, Yu-Meng Lv, Hong-jun Li y Hui-Min He

Departamento de Oncología Médica, Primer Hospital Afiliado de la Universidad Médica de Guangxi, Región Autónoma Zhuang de Guangxi, 6 Shuangyong Road, Nanning, 530021, China

dong lan

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XJC e YBS: concepción del estudio; XJC, YBS, DHL: análisis de datos; LQW y ARZ: curación de datos; XA y ZZF: análisis formal; XHL y YML: administración de proyectos; HJL y DL: Metodología; DL: revisión de los datos experimentales; HMH: Escritura - revisión y edición; XJC y YBS: Redacción del manuscrito. Todos los autores han leído y aceptado la versión publicada del manuscrito.

Correspondencia a Dong Lan o Hui-Min He.

Los autores declaran no tener conflictos de intereses.

Este proyecto fue aprobado por el Comité de Aprobación Ética del Primer Hospital Afiliado de la Universidad Médica de Guangxi (No. 2022-KT-transverse item-029) y la privacidad de los pacientes estuvo bien protegida durante el proceso de este proyecto. Todos los procedimientos realizados en estudios con participantes humanos estuvieron de acuerdo con los estándares éticos del comité de investigación institucional y/o nacional y con la declaración de Helsinki de 1964 y sus enmiendas posteriores o estándares éticos comparables. Se obtuvo el consentimiento informado por escrito de los participantes individuales.

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Reimpresiones y permisos

Chi, XJ., Song, YB., Liu, DH. et al. TRIM69: marcador de metástasis y potencial sensibilizador al 5-fluorouracilo y bloqueadores de PD-1 en adenocarcinoma de colon. BMC Gastroenterol 23, 292 (2023). https://doi.org/10.1186/s12876-023-02927-9

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Recibido: 19 de mayo de 2023

Aceptado: 16 de agosto de 2023

Publicado: 31 de agosto de 2023

DOI: https://doi.org/10.1186/s12876-023-02927-9

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